El postgrado es la actividad académica que ha tenido el mayor desarrollo en las últimas dos décadas. Comenzó como una actividad de educación continua, a través de cursos de actualización para profesionales de la práctica rural. Sin embargo, el desarrollo de los programas de Postítulo y Magíster dio lugar a la creación de una Escuela de Graduados.

El reconocimiento internacional de sus programas ha significado que más del 50% de los postulantes sean extranjeros, permitiendo implementar en el año 1997 un programa de Doctorado en Ciencias Veterinarias, siendo el primero de su tipo en el país.

Para postular a estudios de postgrado en la Universidad Austral de Chile, el interesado deberá poseer un título universitario y/o el grado de Licenciado en su área de interés.